[摘要]

目的:改善胶内酶切的肽段回收率,提高蛋白质的有效鉴定率。方法:将改进的胶内酶切“四步提取法”,应用到96个双向电泳蛋白质斑点分析。

结果:该方法提高了胶内蛋白质酶切肽段的回收率,改善了质谱图谱的质量。蛋白质的有效鉴定率达89.6%,其中,数据库检索得分80分以上者达82%。另外,证实了酶解原液直接用于质谱分析可获得较好信噪比的谱图。

结论:应用“四步提取法”使得酶解肽段提取率和蛋白质的有效鉴定率明显提高。

http://www.cnhupo.cn/bioinfo/mstools/NewInGelDigestion.pdf