近日完成某天然蛋白初步结构测定,做了好几遍,结果跟理论就是不一致,疑惑良久。老外的产品说明书上给的纯度很高,难道序列真错了?
日思夜想,猛然想起做蛋白组研究时,常常为确认目的蛋白是family的哪个member煞费苦心,其原因是,蛋白组研究时,序列覆盖率并不高,很少去做N端序列测定,所以,鉴定结果是一堆同源物!很难具体到某一个特定的成员!这提示,天然蛋白里,同系物很多,司空见惯了。
这样,我们极新的实验结果就没什么值得疑虑的了,一切尊重事实,一切遵从数据!
又比如,某鼠源NGF药物,从鼠脑提取,经过一定纯化,成功获批新药上市,当年报批要求低,结构研究做得少。再注册时(约2010年左右),提了不少要求,其中就有序列测定,结果发现,该药是一系列不同序列剪切体的混合物,约10多个,当时很吃惊,再查文献,发现老外早有此种报道。
本人还做过的天然蛋白或多肽有:蛇毒,蜂毒,蝎毒,芋螺毒,VIII因子,X因子,蛙皮肽,大豆肽,鱼皮肽,等等,蛋白越小,序列不均一越厉害,是体内降解程度不同所致。
总之,你拿到的或购买的天然提取物,别指望它序列很均一,也别相信说明书上给的单一条带,它要牛的话,给一张ESI质谱图吧。但是,存在的,是有理由的,即使序列与理论不完全一致,那也是合理的!
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【wkh, 2019-03-02 00:15:55】
【 125.39.46.19】
【责任人 wkh】
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