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技术】【独家】二硫键组学:有学术意义但有实用意义吗

二硫键是蛋白质构象稳定的重要结构因素,许多蛋白质的功能与二硫键有关。 二硫键定性与定量研究,是蛋白质类药物药学研究的重要内容之一,是结构确证必须研究的内容。 蛋白质二硫键研究的复杂度与蛋白质中Cys数量和分布有密切关系。许多蛋白质存在二硫键异构体。 蛋白质药物由于纯度很高,所以,其二硫键可以研究得比较清楚。

如果蛋白质药物是多个含有二硫键的蛋白质的混合物呢?比如组分药,我没有做过这种未拆分的蛋白质药物的二硫键分析 (抗体是多链,但不是多组分)。从我的经验来看,2~3个蛋白质药物的混合物或多链蛋白(如共价或非共价FSH等),二硫键分析难度是会增加不少,但原则上是可以解决的。 如果再多,我相信我是不会去费那功夫研究的,能拆分就拆分,拆分不了的话,我就会放弃。

蛋白质组学的研究对象就是非常非常多蛋白质的混合物(比如数千到数万个蛋白质), 目前,蛋白质组学主要关注序列鉴定、含量差异、修饰以及相互作用等基于一级序列的相关研究。 如果要研究这些天然混合蛋白质中的二硫键,听上去就十分十分复杂, 如果不是有特别的研究目标,我肯定没人愿意去啃这个硬骨头。

我没在网上查到“二硫键组学”或“disulfide bondomics or disulfide bondingomics”这个概念,看来鲜有人关注这个, 所以,我暂且给这样的定义,以后有更合适的定义,可以改一下。

“二硫键组学”的研究内容应该是目标蛋白质组中全部蛋白质的二硫键状态,可能还包括二硫键异构体(有些天然蛋白有几套二硫键模式)。 以人类蛋白质组为例,大致上有3万个基因,2010年ipiHUMAN_v368数据库中有87061个蛋白(今天已经多达1474680各蛋白质了), 其中,含有Cys的蛋白质有80933,占92.95%(图1),Cys总数为795469个,其二硫键数简直就是天文数字一般。 因此,从学术上讲,到底人体内的蛋白质二硫键是什么样?他们有什么特殊功能吗?很是让人好奇。

然而,如果你真要去研究,实验上可能有难度但应该可以克服(比如强变性、强酶解、不还原), 但其二硫键肽的数量巨大,复杂程度难以想象!即使有天河巨型机可以拿来计算, 但是,谁来编写这种超级复杂的软件呢?有没有比气象预报的算法更复杂?大家来讨论讨论。

基于上述分析,我肯定是不会去做二硫键组学研究的,也没那个能力。





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【wkh, 2021-07-21 20:26:40】 【责任人 wkh】 [已阅读 693 次]


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