当蛋白质的N-端氨基酸为Q（或E）时，经常会发生脱氨环化反应（即焦谷氨酸化修饰，Pyroglutamic acid，Gln->pyro-Glu，PyroQ或PyroE），焦谷氨酸化会导致元素组成变化是H(-3) N(-1)，对应单同位素质量变化是-17.026549Da，对应平均同位素质量变化是-17.0305Da。可以通过完整分子量、焦谷氨选酶结合Edman降解以及酶解串联质谱法进行鉴定。

如果N-端第1位Q与第2位的氨基酸或第3位的氨基酸或其它位置的氨基酸发生脱氨或脱水，即类焦谷氨酸化修饰（sPyroQ或sPyroE），它们导致的完整分子量变化将与PyroQ或PyroE非常接近，对于完整蛋白质来说，从分子量很难判断到底是经典PyroQ还是sPyroQ。当尝试焦谷氨选酶来处理时，将无法象经典PyroQ那样成功去掉第1位Q，从而后续无法成功进行Edman或酶解串联质谱鉴定。

近期，我们就遇到了这样的例子。我们通过不同酶解策略，逐步逼近到N-末端，最终成功追踪到了N-端前2个氨基酸QR。通过多种数据综合分析，初步判断是第1位Q与第2位R发生了脱氨反应。这样的情况很难通过碎片离子进行归属分析，还需要其它方法进行验证。

大家有没有类似的发现？

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【wkh, 2022-05-01 14:36:11】 【责任人 wkh】 [已阅读 762 次]