首先需要声明的是，只要是软件，就会有bugs，不同的使用者会有不同的发现，有人在意，有人不在意。

质谱软件基本上都有bugs，以后慢慢说。 这里说几个很要命的bugs，给数据分析带来了不小麻烦。

去卷积，是蛋白质分子量测定极其关键的一环，算法有多个，但应该有评价机制，但EMR的PD没有。假阳性，是个麻烦事。 峰分叉，与多个因素有关，设定分辨率多少才是真峰？难以把握。EMR峰型函数是什么？能完全对称吗？centroid峰可靠度是多少？它的高度跟原峰面积是什么关系？为什么sliding模式不给出连续谱？

对于肉眼很容易判断的2组峰簇，软件常搞出假峰，难道不识别profile？这个太要命了，需要人为干预才能获得正确分子量。

QE系列采集软件为什么总是有一堆0强度峰？这会增加不少假阳性，一定要剔除这个bug。因为我们的后处理需要进行各种比例统计，原始强度的可靠性很重要。RTINSECONDS线性不好倒也无妨，但是跟UV的RT对应关系究竟如何转换？

标峰，一直是质谱软件既关键又容易出错，这里的算法真是太需要改进了【所有公司都存在这个问题】

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【wkh, 2017-12-20 08:13:44】 【责任人 wkh】 [已阅读 873 次]