【源代码】DE自动保存peaklist文件
Data Explorer 处理数据时,每次都是读取原始文件和参数,然后实时显示峰值,及时你进行了各种图谱处理,中间过程很难保存,每次打开数据时还得重新处理一遍。不知道软件开发人员怎么想的。
峰值文件是数据库查询、各种统计再分析必须要的,可是DE每个图谱都要人工copy,并不能直接保存为text文件,数据少的时候,没问题。
昨天,学生们已经无可奈何了,因为有数百张图谱要处理,每个都process一下和copy的话,确实工作量巨大。为此,本人研究了一下那个 Automation Macro,写了以下代码,与大家分享。
此源代码功能说明:
1 如果引用,请保留wkh的declare以及存盘文件后缀“wkh.txt” ,以示对本人的尊重。
2 自动基线处理主要适合我们的大样本血清线型模式的数据,如果你是别的检测模式,要选择其它baseline校正。
3 降噪和平滑主要针对线型方式,反射条件下,不推荐。
4 此代码只输出 m/z, Area, Normalized Intensity,如果需要输出别的信息(如电荷、s/n,分辨率等),自己添加进去。
5 自动保存的文件路径显示在result窗口,跟你的原始文件在一起。
下载地址:http://www.cnhupo.cn/bioinfo/mstools/de_peaklist_code.rar
更多精彩文章,请关注公众号 【药网堂】
All rights reserved , visit the micromessage 药网堂 for more @ tofms_org@126.com

【wkh, 2012-08-27 10:09:22】
【责任人 wkh】
[已阅读 2003 次]
|