质谱，当前极热的分析仪器，国内外的质谱厂家越来越多，大家玩命拼硬件，可是，光有硬件是没法玩的。本人曾经多次谈过质谱软件当前的一些问题，很遗憾的是，改进者少。这不，又发现一个麻烦事。昨天处理UPLC~MS/MS数据，发现其导出的mgf无法成功用于国际极权威的mascot检索，仔细研究了该公司软件导出的mgf，惊奇的发现，不仅格式不通用，而且存在2大严重错误，我研究了近一小时，终于通过代码解决了些些问题，并成功用于mascot检索。

1 【电荷计算错误】……居然有太多9电荷~12电荷的肽段，应该是把噪音当信号参与计算了。所以，要避免假阳性，一定要打开原始质谱图核实。所以，我们的研究报告都有很多关键图谱截图，确保证据确凿。

2 【峰值计算绝对错误】大概存在8% 的我100% 确认的不存在的m/z。具体保密。

玩质谱，要硬势力，也要软势力

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【wkh, 2017-08-24 06:48:37】 【 183.61.51.208】 【责任人 wkh】 [已阅读 975 次]