脱水是蛋白和多肽常见杂质来源之一，与序列和工艺均有关系，当其比例超过一定值后，需要进行详细结构确证研究。

ms/ms碎片匹配不仅是鉴定蛋白质的关键，更是修饰鉴定不可缺少的环节。在我们的常规工作中，主要修饰和特殊修饰都必须给出ms/ms图且匹配要良好以上。

脱水较为特殊，一则缺少特异性，二则ms/ms碎片就有脱水碎片，它很可能与样品脱水混淆。因此，串联质谱鉴定脱水时，需仔细区分碎片脱水和样品脱水。

更重要的是，当C末端氨基酸侧链连接了可参与脱水的氨基酸或有机物时，脱水情况就复杂多了。此时，必须严格区分【肽段C末端COOH】与【侧链的COOH】，比如，肽段C末端氨基酸为K，而它的侧链被E修饰，这样ms/ms的序列碎片离子肯定无法用来分析脱水，而侧链碎片离子【包括亚氨离子】可能比较复杂，而且也难以区分上述2种情况。因此，单纯的ms/ms基本上不能有效鉴定C末端COOH与C末端侧链COOH参与脱水。

去年以来，我们在此方面进行了大量探索，发现需要多种样品前处理和多种质谱联合，才能完成上述鉴定，并且，一般来说，是2种情况共存，因此，需要计算它们的比例。



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【wkh, 2019-04-08 08:57:58】 【责任人 wkh】 [已阅读 752 次]