肽图是蛋白质类药物企业放行和注册检验需要的项目（部分多肽也适用），但是目前有些理念并未形成共识。

   【1】部分药企放行的HPLC肽图的实验方法与结构确证中的质量肽图（也就是我常说的“肽图峰归属”）的实验方法没有关系，也就是，这些药企的HPLC肽图中的色谱峰并未被串联质谱鉴定，我有理由认为，他们的质控峰的合理性和科学性存疑。我曾经遇到过某药物的质控峰居然不是该蛋白的肽段而是辅料（该药当时已收录到药典里，肽图也在其中），辅料虽然不是绝对不可用纳入质控，但肯定不能按“肽图”来质控。因此，我建议，HPLC肽图方法与结构质量肽图保持一致。

   【2】肽图中的酶解方法，与蛋白序列有密切关系，需要酌情选择蛋白酶。当然，药企可用借鉴药典方法，但并是所有蛋白都可以照搬药典方法。即使该蛋白药物已收录了药典，但肽图方法没有被收录，也要谨慎采用药典方法。比如，鱼精蛋白已收录入药典多年（图1），但没有肽图检测项。鱼精蛋白有非常丰富的序列变体，其中申报药物时的序列都比较短而且富含Arg（图2）,如果照搬药典里的Trypsin酶解，其结果就完全没有科学性了，导致肽段的长度仅仅在1~4个AAs，完全失去了质控的意义。因此，我建议，鱼精蛋白的肽图需要特殊的酶解方法，当然，我个人认为，肽图对该蛋白意义不大，不如直接全长序列测定来得有效。

【wkh, 2024-10-28 10:32:11】 【责任人 wkh】 [已阅读 152 次]