谨慎看待蛋白晶体结构结果

对蛋白来说，溶液结构更接近天然状态，但晶体结构远比3D NMR普及得多，主要是实验难度决定的。使用晶体结构数据，需要注意以下几点:

1 晶体法由于是单晶，要求目标蛋白纯度很高，不能得到小含量杂蛋白【如非预期剪切、修饰等】或异构体【如非预期二硫键】的含量或结构。

2 制备单晶时，使用了一些辅助结晶试剂【如盐类】，要注意它们可能对目标蛋白的空间结构有影响。我们做了一些金属离子对CD的影响，结果显示，不同类型的金属及其浓度会改变二级结构，因此推测也会改变三级结构。

3 注意目标蛋白是单链还是双链。如果其它数据结果显示，该蛋白药物是双链，而晶体结构给出的是单链，那一定是结晶条件出问题了，需要重做。其中，要特别关注导致解聚的因素。

4 如果蛋白活性形态是非共价双链，且共价双链没有活性或活性很低，则一定要确定晶体结构是共价双链【多数是链间二硫键所致】，还是非共价双链【要排除链间二硫键】。

5 如果双链结构是非同源双链，则还必须完全确定各链的结构归属，尤其紧密结构处，不能错误解析序列片段，更不能误读了异源双链的相互作用区域。采用其它方法验证晶体结构中的交联位点和互作区域，是十分必要的。

总之，对于第三方出具的数据和结果，企业需要努力去正确理解，结合不同来源的检测项目和结果，多归纳比较分析，谨慎使用，避免盲目照抄【有些CRO责任心或学术水平有限，时不时误导客户】。



更多精彩文章，请关注公众号 【药网堂】

All rights reserved , visit the micromessage 药网堂 for more @ tofms_org@126.com

【wkh, 2020-01-22 08:39:34】 【责任人 wkh】 [已阅读 604 次]