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项目进展】【原创】自编软件已支持多位点多糖型共存

最近在解析新冠疫苗数据时,发现不得不考虑"多位点多糖型"(原则上应避免),但我此前写的糖型解析软件不支持这种情况,节前尝试了msb方法,结果发现效果不行。试过好些第三方软件,总是觉得没可信度,起码它们没有提供有价值的信息确认它们的可信度(问过N次也没有获得有用的回答)。

不得不重新开启ms/ms碎片匹配N-糖型鉴定的算法研究和代码编写工作,研究了多种技术方案,建立了各种数据库,不断优化,不断条件简化,不断去假阳性,大致出来个初始版本。试运行发现些小问题,又不断调试、不断改进,分段测试成功。

O-糖复杂些,数据库比较大,通过本实验室已经完成了的O-糖数据结果,适当进行了优化,改进了算法,应该算是比较完善了。

总结近20年做新药结构研究的经验,本人感觉,如果不会写程序的话,会导致很多做法非常勉强或漏洞明显。某知名CRO前不久在新冠疫苗审评上就面临这种尴尬境地,不能回答专家的提问。

但是,我们必须牢记,方法学是药学研究的基础,不仅仅实验方法,还有数据解析方法,同等重要。我个人认为,实验方法是第一步,第一要尽量完善。数据分析也需要多种方法验证,关键结果不能只有单一证据。孤证,是做药的大忌。

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【wkh, 2021-10-11 13:51:35】 【责任人 wkh】 [已阅读 576 次]


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