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项目进展】【存疑】新冠S蛋白三聚体15个自由巯基?

【存疑】新冠S蛋白三聚体15个自由巯基?

随机选择PDB中的新冠病毒S蛋白三聚体的晶体结果数据(图1),蛋白编号为6X29。下载pdb、fasta等数据, 提取Cys和二硫键信息,进行归纳整理,发现每条链有5个自由巯基,链内二硫键12种, 链间二硫键1种Cys383-Cys985,AB、AC、BC共3对。自由巯基那么多、链间二硫键那么少, 应该是高度存疑,与其表达和结晶过程有关。此外,我们已经证明共价三聚体为绝对主要(即,由链间二硫键连接), 还有少量非共价三聚体,而单体或二聚体基本难以检出。

总之,我们的实验结果初步判断,S蛋白绝对主要形成共价三聚体。三聚体可以通过某些非还原处理方法产生高聚体(6聚体和9聚体); 三聚体肯定有几个自由巯基,但是否有15个那么多,高度存疑,但我们还在反复验证中。









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【wkh, 2021-02-28 13:22:40】 【责任人 wkh】 [已阅读 714 次]


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